Codon Preference in 50 Proteins of Wheat (Triticum Aestivum)

 
AmAcid   Codon     Number        /1000       Fraction 
 
Ala      GCG       266.00        14.38         0.18 
Ala      GCA       343.00        18.55         0.23 
Ala      GCT       427.00        23.09         0.28 
Ala      GCC       478.00        25.85         0.32 
 
Cys      TGT        76.00         4.11         0.26 
Cys      TGC       211.00        11.41         0.74 
 
Asp      GAT       637.00        34.45         0.53 
Asp      GAC       555.00        30.01         0.47 
 
Glu      GAG       823.00        44.50         0.63 
Glu      GAA       476.00        25.74         0.37 
 
Phe      TTT       254.00        13.73         0.40 
Phe      TTC       380.00        20.55         0.60 
 
Gly      GGG       312.00        16.87         0.21 
Gly      GGA       351.00        18.98         0.24 
Gly      GGT       311.00        16.82         0.21 
Gly      GGC       495.00        26.77         0.34 
 
His      CAT       213.00        11.52         0.42 
His      CAC       292.00        15.79         0.58 
 
Ile      ATA       180.00         9.73         0.19 
Ile      ATT       328.00        17.74         0.34 
Ile      ATC       452.00        24.44         0.47 
 
Lys      AAG       970.00        52.45         0.77 
Lys      AAA       297.00        16.06         0.23 
 
Leu      TTG       244.00        13.19         0.16 
Leu      TTA        81.00         4.38         0.05 
Leu      CTG       348.00        18.82         0.22 
Leu      CTA       139.00         7.52         0.09 
Leu      CTT       317.00        17.14         0.20 
Leu      CTC       419.00        22.66         0.27 
 
Met      ATG       488.00        26.39         1.00 
 
Asn      AAT       259.00        14.01         0.45 
Asn      AAC       311.00        16.82         0.55 
 
Pro      CCG       208.00        11.25         0.22 
Pro      CCA       242.00        13.09         0.26 
Pro      CCT       250.00        13.52         0.27 
Pro      CCC       230.00        12.44         0.25 
 
Gln      CAG       420.00        22.71         0.61 
Gln      CAA       263.00        14.22         0.39 
 
Arg      AGG       300.00        16.22         0.23 
Arg      AGA       213.00        11.52         0.16 
Arg      CGG       187.00        10.11         0.14 
Arg      CGA       132.00         7.14         0.10 
Arg      CGT       156.00         8.44         0.12 
Arg      CGC       312.00        16.87         0.24 
 
Ser      AGT       168.00         9.08         0.16 
Ser      AGC       216.00        11.68         0.20 
Ser      TCG       133.00         7.19         0.12 
Ser      TCA       161.00         8.71         0.15 
Ser      TCT       192.00        10.38         0.18 
Ser      TCC       199.00        10.76         0.19 
 
Thr      ACG       115.00         6.22         0.15 
Thr      ACA       210.00        11.36         0.27 
Thr      ACT       191.00        10.33         0.25 
Thr      ACC       256.00        13.84         0.33 
 
Val      GTG       420.00        22.71         0.34 
Val      GTA       118.00         6.38         0.10 
Val      GTT       325.00        17.57         0.26 
Val      GTC       367.00        19.85         0.30 
 
Trp      TGG       173.00         9.35         1.00 
 
Tyr      TAT       194.00        10.49         0.39 
Tyr      TAC       299.00        16.17         0.61 
 
End      TGA        69.00         3.73         0.63 
End      TAG        18.00         0.97         0.16 
End      TAA        23.00         1.24         0.21 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Help